Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stxbp4Q9WV89 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stxbp4Q9WV89 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms