Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pfdn5Q9WU28 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms