Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vav3Q9R0C8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms