Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms