Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfcp2Q9ERA0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms