Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnft1Q9DCN7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnft1Q9DCN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnft1Q9DCN7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnft1Q9DCN7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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