Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pop7Q9DCH2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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