Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Csnk1dQ9DC28 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms