Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms