Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrpraQ9DBG7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms