Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cldn22Q9D7U6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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