Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmigd1Q9D7L8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmigd1Q9D7L8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmigd1Q9D7L8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmigd1Q9D7L8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tmigd1Q9D7L8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms