Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3404Q9D506 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3404Q9D506 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3404Q9D506 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3404Q9D506 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3404Q9D506 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3404Q9D506 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3404Q9D506 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm3404Q9D506 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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