Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms