Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy3Q9D394 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms