Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms