Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms