Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms