Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp2Q9CYZ8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms