Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tdrd12Q9CWU0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tdrd12Q9CWU0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tdrd12Q9CWU0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tdrd12Q9CWU0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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