Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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