Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms