Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Chchd5Q9CQP3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Chchd5Q9CQP3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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