Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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