Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubqln4Q99NB8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms