Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms