Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hps4Q99KG7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hps4Q99KG7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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