Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms