Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms