Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms