Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trappc12Q8K2L8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms