Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scara5Q8K299 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scara5Q8K299 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scara5Q8K299 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scara5Q8K299 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scara5Q8K299 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms