Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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