Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpm6Q8CIR4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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