Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Brf1Q8CFK2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brf1Q8CFK2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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