Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdca8Q8BHX3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms