Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc172Q810N9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc172Q810N9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc172Q810N9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc172Q810N9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc172Q810N9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc172Q810N9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc172Q810N9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc172Q810N9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc172Q810N9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc172Q810N9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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