Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Smim19Q80ZU4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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