Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Amigo1Q80ZD8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Amigo1Q80ZD8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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