Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ClmQ7TSN2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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