Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms