Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc2bQ7TPM1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms