Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms