Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zbtb40Q6PCS8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms