Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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