Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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