Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall3Q62255 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms