Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms