Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms