Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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JrkQ60976 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms